Evolutionsbiologen teilen phylogenetische Gruppen (geschlossene Abstammungsgemeinschaften) in Kladen. Die Kladen unserer Hunde und der Hundevorfahren sind mit A, B, C, D, E und F bezeichnet. Von besonderer Bedeutung sind die Kladen A, B und C, da die anderen selten vorkommen, geographisch isoliert sind oder von Hund-Wolf-Hybriden nach der Domestizierung stammen. Die Kladen A, B und C bestehen aus mehreren Untergruppen, den sogenannten Haplogruppen. Diese Haplogruppen sind in 97,4 – 100 Prozent aller Hunde wieder zu finden. Sie stammen ursprünglich alle von einem männlichen oder weiblichen Wolf ab, der vor zehntausenden von Jahren lebte.