Haplotyp (altgriechisch „einfach“) ist eine Abkürzung für haploider Genotyp. Haplo (einfach) da eine Variante einer Nukleotidsequenz (Abfolge der Nukleotide einer Nukleinsäure) auf ein und demselben Chromosom im Genom eines Lebewesens bezeichnet wird. Ein bestimmter Haplotyp kann individuen-, populations- oder auch artspezifisch sein. Haplotypen sind demnach ganz bestimmte DNA-Sequenzen, die vollständig von der Mutter oder dem Vater eines Hundes geerbt werden und nicht wie andere Teile des Genoms, neu kombiniert (Rekombination) werden.