Studie - Validierung eines Chromosom-14-Risiko-Haplotyps für idiopathische Epilepsie beim belgischen Schäferhund, der mit einer Insertion in das RAPGEF5-Gen assoziiert ist

17.09.2022 19:20
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Admin-Team

ZUR STUDIE

Es wurde berichtet, dass ein idiopathischer Epilepsie-Risiko-Haplotyp (IE) auf dem Canine-Chromosom (CFA) 14 mit dem CFA37-Common-Risk-Haplotyp beim Belgischen Schäferhund (BS) interagiert. Zusätzliche IE-Fälle und Kontrollhunde wurden für die Risiko-Haplotypen genotypisiert, um diese früheren Ergebnisse zu validieren. In der neuen Kohorte erhöhte die Interaktion zwischen den beiden Regionen das IE-Risiko signifikant. Wenn die Haplotypen einzeln analysiert wurden, waren bestimmte Haplotypen sowohl auf CFA14 (ACTG) als auch auf 37 (GG) mit einem erhöhten IE-Risiko assoziiert, obwohl nur der CFA37 AA signifikant assoziiert war (p < 0,003) mit einem reduzierten Risiko in der neuen Kohorte. Das CFA14-ACTG-Risiko war jedoch statistisch signifikant, wenn die neuen und früheren Kohortendaten kombiniert wurden. Die Häufigkeit des ACTG-Haplotyps war bei BS-Hunden viermal höher als bei anderen Rassen. Die Analyse der gesamten Genomsequenz ergab, dass ein 3-Basen-Paar eine störende Insertion in das RAPGEF5-Gen vorhersagte, das an den CFA14-Risikohaplotyp angrenzt. RAPGEF5 ist am Wnt-β-Catenin-Signalweg beteiligt, der für die normale Gehirnfunktion entscheidend ist. Obwohl diese Risikovariante die Wahrscheinlichkeit, dass ein BS IE entwickelt, nicht vollständig vorhersagt, kann die Assoziation mit einer Variante in einem Kandidatengen einen Einblick in die genetische Kontrolle von Hunde-IE geben.


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